真菌的DNA和RNA提取方法

發(fā)布時間:2024-03-20
一、真菌dna的提取(方法一)
1.實驗試劑
(1)dna提取液:0.2m tris-hcl(ph 7.5),0.5m nacl,0.01m edta,1%sds
(2)3m naac
(3)te:10 mmol/l tris-hcl ph8.0,1 mmol/l edta
(4)酚(ph8.0):氯仿:異戊醇(25:24:1)
(5)氯仿:異戊醇(24:1)
(6)異丙醇
(7)無水乙醇
(8)75%乙醇
(9)rnasea
2.實驗步驟
(1)取真菌菌絲0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉
(2)加入4ml提取液,快速振蕩混勻
(3)加入等體積的4ml的氯仿:異戊醇(24:1),渦旋3~5min(此處是粗提沒有加酚,可以節(jié)約成本)
(4)1000rpm,4℃,5min
(5)上清用氯仿:異戊醇(24:1)再抽提一次(10,000rpm,4℃離心5min)
(6)取上清,加入2/3倍體積的-20℃預(yù)冷異丙醇或2.5倍體積的無水乙醇沉淀, 混勻, 靜置約30 min
(7)用毛細玻棒挑出絮狀沉淀,用75%乙醇反復(fù)漂洗數(shù)次,再用無水乙醇漂洗1次,吹干,重懸于500ul te中
(8)加入1ul rnasea (10mg/ml),37℃處理1h
(9)用酚(ph8.0):氯仿:異戊醇(25:24:1)和氯仿:異戊醇(24:1)各抽提1次(10,000rpm,4℃離心5min)
(10)取上清,1/10v 3m naac,2.5v體積的無水乙醇,-70℃沉淀30min以上
(11)沉淀用75%乙醇漂洗,風(fēng)干,溶于200ul te中,-20℃保存?zhèn)溆?br>二、真菌dna的提取(方法二)
1.真菌菌絲0.5-1g,在液氮中迅速研磨成粉
2.加入3ml 65℃預(yù)熱的dna提取緩沖液,快速振蕩混勻65℃水浴30min,期間混勻2-3次
3.加入1ml 5m kac,冰浴20min
4.氯仿:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃離心5min)
5.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預(yù)冷異丙醇,混勻,靜置約30 min
6.用毛細玻棒挑出絮狀沉淀,用75%乙醇反復(fù)漂洗數(shù)次,再用無水乙醇漂洗1次,吹干,重懸于500ul te中
7.加入1ul rnasea(10mg/ml),37℃處理1h
8.用酚(ph8.0):氯仿:異戊醇(25:24:1)和氯仿:異戊醇(24:1)各抽提1次(10,000rpm,4℃離心5min)
9.取上清,1/10v 3m naac,2.5v體積的無水乙醇,-70℃沉淀30min以上
10.沉淀用75%乙醇漂洗,風(fēng)干,溶于200ul te中,-20℃保存?zhèn)溆?br>dna提取緩沖液:100mm tris-hcl(ph8.0),20mm edta(ph8.0),1.5m nacl,2% ctab(w/v),4% pvp40(w/v)和2%巰基乙醇(v/v),pvp和巰基乙醇使用前加入5m kac
方法一和二,是大同小異。主要是dna提取液配方不一樣!成本也不一樣!
三、真菌菌絲的總rna的提取
1.實驗試劑
(1)rna提取緩沖液(ctab):2% ctab(w/v),2% 聚乙烯吡咯烷酮pvp(w/v),100mm tris-hcl(ph8.0,depc處理的水配置),25mm edta,0.5g/l 亞精胺spermidine,2.0m nacl,2%巰基乙醇(v/v,使用前加入)。由于在高溫滅菌條件下,tris-hcl要和depc發(fā)生反應(yīng),所以配rna提取緩沖液時直接用depc處理的水配制即可
(2)sste:1 m nacl,0.5% sds(w/v),10mm tris-hcl ph8.0,1.0mm edta
(3)10m licl 直接用蒸餾水配10m licl,加1‰的depc過夜后,高溫滅菌
(4)3m naac
(5)氯仿:異戊醇(24:1)
(6)酚(ph4.5):氯仿:異戊醇(25:24:1)
(7)depc處理水 用1‰的depc處理蒸餾水過夜,高溫滅菌
(8)無水乙醇;70%酒精
2.實驗步驟
(1)實驗開始前將rna提取液于65℃水浴鍋中預(yù)熱,離心管中加入me(巰基乙醇),(10ml加80ul,50ml中加入300ul)
(2)取約0.8g菌絲體(液體培養(yǎng)獲得的菌絲用真空抽濾即可!固體培養(yǎng)就更好說了),在液氮中迅速磨成精細粉末,裝入50ml離心管,按1g材料8ml的量加入預(yù)熱的rna提取液,顛倒混勻
(3)65℃水浴3-10 min,期間混勻2-3次
(4)加入等體積的酚(注意是酸酚ph4.5):氯仿:異戊醇(25:24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)
(5)取上清,等體積的氯仿:異戊醇(24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)
(6)加入1/4v體積10m licl溶液,4℃放置6h以上(或過夜)
(7)10,000rpm,4℃離心20min
(8)棄上清,用500ul sste溶解沉淀
(9)酚:氯仿:異戊醇(25:24:1)抽提兩次,氯仿:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃,5min)
(10)加2v體積的無水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30min以上
(11)12,000rpm,4℃離心20 min
(12)棄上清。沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥
(13)加200ul的depc處理水溶解
(14)用非變性瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計掃描檢測rna的質(zhì)量
(在抽提過程中,若蛋白質(zhì)含量或其它的雜質(zhì)還較多,可以增加抽提次數(shù))
注意:提取rna請盡量在低溫下操作,如果條件不容許,在室溫下操作的時間要盡可能的短。
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