工程結算應分為幾個階段：準備階段，編制階段，報審階段，審定階段。
1、準備階段。這是許多人不重視或者沒認識到的階段。這個階段，實際上是一個非常重要的階段。在這個階段，要為結算編制準備好充實的基礎資料，以支持所編制的結算真實性、科學性。這個階段，從工程招投標開始，至工程竣工結算編制結束，貫穿于工程建設全過程中。
工程招投標中的結算準備：一個成熟的造價工作者，在工程招投標時，不僅僅是簡單的核算招標清單的準確性，而是在復核了招標清單的準確性的基礎上，結合招標文件上確定了的關于結算的合同條款，對招標清單的錯漏之處進行細致的分析，考慮好如何在結算時加以充分利用，然后再決定如何提出對招標文件及清單的澄清意見，并在報價中進行相應處理。如某招標清單中，門窗部份，設計為木窗，而投標人知道業(yè)主將來要改為鋁合金窗，在報價時把木窗價格相對報得低一點，結算時扣除時的結果大家就都能想到的了。
工程施工過程中的結算準備：在施工過程中的結算準備工作，主要是對索賠事件的處理。也就是行業(yè)中俗稱的簽證處理?，F(xiàn)在有許多建設單位的人，他們不了解索賠是什么回事，也豈諱有人對他們說索賠什么的，所以，要哄得他們開心，就別對他們提什么索賠的事。簽證工作對結算的重要性，我相信所有和工程有關系的人都知道的，所謂“中標靠壓價，賺錢靠索賠”，就不用多說了。在起草簽證文件時，要注意詞語得當，因果關系明確，要把引起工程費用增加的責任確定在建設單位。
另外起草簽證文件時還要注意不和合同上的相關條款有沖突。簽證內容主要有這么幾類：工程變更簽證(包括建設單位含設計、監(jiān)理單位的書面通知、口頭通知等，設計交底材料)、材料價格認定等。如果某些重大變更影響到合同內容的，則需要簽訂補充協(xié)議。
簽證文件經相關人員簽認后，應盡早的計算出相應的造價變化文件。供結算時使用。另外，引起工程造價改變的事件發(fā)生后，應在其時效時間內做好簽證工作。以免過了時效，不能索賠。
竣工時的結算準備：此時主要準備工作主要是把前面形成的各種資料匯編起來，供結算時使用。
2、結算編制階段。這個階段主要是依據合同和工程簽證變更資料，計算出結算造價。在形成結果時，要有藝術性。一個好的造價工作者，往往不會去片面追求準確性。大家都知道的，施工單位的結算是要經過審核后才能作為結算依據的。因此，要放點水，給審核單位留下核減的空間。審核單位的也要吃飯的，沒有核減額，他們的利益就少了。此時，他們會拼命的找地方下手，形成他們認為理想的核減額。
3、結算報送階段。很簡單，只合同約定的時間內，把結算按合同要求提交給建設單位就可以了。
4、審定階段。此也是一個核心階段，在這個階段中，結算編制人員要和建設單位委托的審核單位的造價人員面對面的進行接觸，商定最后造價。通常是這么幾個過程：審查合同和簽證文件，篩選出無效簽證；對量，按篩選后的簽證計算應該結算的工程量；計價，按雙方認可的工程量，按合同的約定進行計價。最后的結果，就是審定的結算，也就是建設單位和施工單位結算的最后依據。這個過程中，如何處理，不同的人有不同的方法，反正目的就是一個，讓審核的人接受自己的觀點，保證單位的利益。
如果對形成的結果不滿意，雙方需要多商量，千萬別整什么“我是造價師，你是造價員，你沒資格審我編的結算”之類傷感情的話。對真正不滿意的結果，你可以選擇拒絕在結算報告上簽字，簽字后你就沒法再挽回了。