1.固定相的選擇
非極性分子——通常僅由 c 和 h 組成并 且無偶極矩，直聯(lián)（正烷）是常見的非極性化合物的例子。
極性分子——主要由 c 和 h 組成同時也 有其他原子，如：n、o、p、s 或鹵素。樣品包括有醇類、胺類、硫醇類、酮類、有機鹵化 物等。
可極化物質(zhì)——主要由 c 和 h 組成同時 包含不飽和鍵。通常有：炔和芳香族化合物。
如果你的樣品是具有相似的化學(xué)性質(zhì)的 非極性組分的混合物，比如大多數(shù)石油餾分中 的烴，你可以試用 ov-1 毛細管色譜柱，它按沸點順序分離。如果你懷疑有芳族化合物，試 著用有苯基的 se-52 或 se-54 柱。
極性或可極化組分樣品能夠在中極性和/ 或可極化固定相色譜柱上進行分析，如有苯基 或類似基團固定相，比如 ov-17 或 ov-225 柱。如果需要更高極性，可以選用聚乙二醇（p eg）固定相，即通常所說的 wax 固定相。
2.膜厚選擇
薄膜比厚膜洗脫組分快、峰分離好、溫度低。
一般而言，色譜柱的膜厚為 0.25 到 0.5 μm。對于流出達 300℃的大多數(shù)樣品（包括 蠟、甘油三脂、甾族化合物等）能夠很好的分 析。對于更高的洗脫溫度，可以用 0.1μm 的 液膜。而厚液膜對于低沸點化合物有利，對于 流出溫度在 100℃～200℃之間的物質(zhì)，用 1～ 1.5μm 的液膜效果較好。超厚膜（3～5μm） 用于分析氣體、溶劑和可吹掃出來的物質(zhì)，以 增加樣品組分與固定相的相互作用。另一個選 擇厚膜的原因是當(dāng)用大口徑柱時保持分離度 和保留時間。由于這個原因，大口徑柱都只有厚膜。厚膜的流失較大，溫度極限必須隨膜厚度增加而下降。
3.長度選擇
一般情況，15m 柱用于快速篩選簡單混合 物或分子量*高的化合物。30m 柱是*普遍的柱長。超長柱（50、60 或 100m、150m）用于 非常復(fù)雜的樣品。
柱長度在柱性能上不是一個重要參數(shù)，例 如：加倍柱長，恒溫分析時間則加倍但峰分辨 率僅增大約 40%。如果分析只是比較好但不是 特別好時，有比增加柱長度更好的辦法來改進 分析結(jié)果，如考慮更薄的膜，優(yōu)化載氣流量或 用程序升溫等。
分析活性*強的組分是一種特殊情況。如 果樣品與柱材質(zhì)接觸，那么峰會嚴重拖尾。較 厚的膜、相對短的柱可以由于較少的柱材和較 厚的固定液體掩蓋其表面以屏蔽活性表面,從 而減少相互作用的機會。
4.內(nèi)徑選擇
增加直徑意味著需要更多的固定相，即使厚度不增加，也有較大的樣品容量。同時也意味著降低了分離能力且流失較大。小口徑柱為 復(fù)雜樣品提供了所需的分離，但通常因為柱容 量低需要分流進樣。如果分離度的降低能夠接 受的話，大口徑柱可以避免這一點。當(dāng)樣品容 量是主要的考慮因素時，如：氣體、強揮發(fā)性 樣品、吹掃和捕集或頂空進樣，大內(nèi)徑甚至 p lot 柱可能比較合適。
同時色譜柱內(nèi)徑的選擇中要考慮儀器的限制和要求。填充柱的進樣口可以使用大口徑毛細管柱（0.53mm 內(nèi)徑），而小口徑柱就不 一定能夠被連接在儀器上使用。毛細管柱的進 樣口一般可以用于所有內(nèi)徑范圍的毛細管柱。（0.1mm、0.25mm、0.32mm、0.53mm）直接聯(lián)用的 gc/msd和 msd 需要小口徑柱，因為真空泵不能處理大口徑柱的大流量。查明你的整個系統(tǒng)看看你適合那些柱內(nèi)徑的色譜柱。