翌圣ZymeEditor™轉(zhuǎn)座酶系列產(chǎn)品全面助力NGS文庫(kù)構(gòu)建

發(fā)布時(shí)間:2024-04-03
ta克隆建庫(kù)技術(shù)是目前商業(yè)化建庫(kù)的主流方式,通常需要片段化、末修加a、接頭連接、pcr擴(kuò)增等實(shí)驗(yàn)流程,操作復(fù)雜,且建庫(kù)周期長(zhǎng)。與ta克隆建庫(kù)技術(shù)相比,轉(zhuǎn)座酶法建庫(kù)在dna片段化的同時(shí)給dna片段加上測(cè)序接頭,可替代ta克隆中的片段化、末修加a、接頭連接步驟,在后續(xù)建庫(kù)擴(kuò)增過(guò)程中,一步法pcr建庫(kù)就能獲得完整的用于測(cè)序的文庫(kù),具有操作簡(jiǎn)便、極大縮短建庫(kù)時(shí)長(zhǎng)等優(yōu)點(diǎn)。
圖1. 基于tn5酶的建庫(kù)流程
tn5酶作為轉(zhuǎn)座酶法建庫(kù)的核心酶原料,在ngs領(lǐng)域應(yīng)用十分廣泛,除了應(yīng)用于dna建庫(kù)外,還可應(yīng)用于快速rna建庫(kù)、atac、cut&tag、單細(xì)胞測(cè)序等技術(shù)。(點(diǎn)擊)
翌圣zymeeditor™酶改造平臺(tái)精心打造轉(zhuǎn)座酶系列產(chǎn)品:tn5 transposase(cat#14524es)、pa-tn5 transposase(cat#14528es)、pg-tn5 transposase(cat#14530es)以滿(mǎn)足不同應(yīng)用需求。
部分?jǐn)?shù)據(jù)展示
1、5u投入量無(wú)核酸外切酶殘留
將1 u/5 u的pg-tn5 transposase分別與底物dna在37°c下孵育4 h,瓊脂糖凝膠電泳比較dna譜帶變化。結(jié)果顯示翌圣pg-tn5 transposase在5 u投入量下無(wú)核酸外切酶殘留。
圖2.pg-tn5 transposase核酸外切酶殘留檢測(cè)
2、相同酶投入量下,片段化能力優(yōu)于其它品牌
分別使用翌圣及品牌a相同酶量的pg-tn5 transposase對(duì)200 ng gdna進(jìn)行片段化,agilent 2100檢測(cè)片段大小分布,結(jié)果顯示:相同酶量下,翌圣pg-tn5 transposase片段化效果更好,酶活性更高。
圖3. pg-tn5 transposase片段化能力檢測(cè)
3、應(yīng)用于cut&tag建庫(kù)產(chǎn)量更高
分別使用翌圣及品牌a相同酶量的pg-tn5 transposase對(duì)1000個(gè)細(xì)胞投入量樣本建庫(kù),并對(duì)文庫(kù)測(cè)序后的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,結(jié)果顯示翌圣pg-tn5 transposase文庫(kù)產(chǎn)量高于品牌a(圖4a),mapping率相當(dāng)(圖4b); 染色質(zhì)上的信號(hào)分布情況與品牌a一致(圖5)。
圖4. pg-tn5 transposase應(yīng)用于cut&tag的文庫(kù)產(chǎn)量及mapping率
圖5. pg-tn5 transposase應(yīng)用于cut&tag在染色質(zhì)上的信號(hào)分布
產(chǎn)品推薦
應(yīng)用
定位
產(chǎn)品名稱(chēng)
產(chǎn)品貨號(hào)
轉(zhuǎn)座酶建庫(kù)atac建庫(kù)
tn5單酶
tn5 transposase
14524es
建庫(kù)試劑盒
hieff ngs® fast tagment dna library prep kit for illumina®(for 50 ng)
12207es
cut&tag建庫(kù)
pa-tn5單酶
pa-tn5 transposase
14528es
pg-tn5單酶
pg-tn5 transposase
14530es
建庫(kù)試劑盒
hieff ngs® g-type in-situ dna binding profiling library prep kit for illumina
12598es
翌圣zymeeditor™
酶改造定制服務(wù)
翌圣zymeeditor™是一個(gè)酶改造底層技術(shù)平臺(tái),它基于翌圣生物多年在分子酶改造領(lǐng)域中的技術(shù)積累與知識(shí)拓展,該平臺(tái)已具備對(duì)多種酶的多種需求進(jìn)行定向改造的能力。因此,zymeeditor™平臺(tái)從2023年開(kāi)始正式推出酶改造對(duì)外定制服務(wù),可為各種應(yīng)用領(lǐng)域(如醫(yī)藥、診斷、食品、化工等)的客戶(hù)提供全套酶改造服務(wù),也可以單獨(dú)提供蛋白發(fā)酵及純化工藝開(kāi)發(fā)優(yōu)化、規(guī)模化生產(chǎn)服務(wù),以滿(mǎn)足不同客戶(hù)的需求,助力產(chǎn)業(yè)升級(jí)。
定制服務(wù)流程
圖6.zymeeditor™酶改造定制服務(wù)流程
上一個(gè):信百諾高低溫試驗(yàn)箱對(duì)使用環(huán)境有什么要求
下一個(gè):粘稠度大的污水平衡池推流器選型,選用齒輪箱減速機(jī)內(nèi)部結(jié)構(gòu)圖

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