一個油茶金屬硫蛋白基因的克隆與序列分析

發(fā)布時間:2024-04-03
在油茶cdna文庫和est文庫構(gòu)建的基礎(chǔ)上,根據(jù)油茶金屬硫蛋白的est序列設(shè)計特異引物,以油茶近成熟種子為材料,利用3'race技術(shù),克隆到1個金屬硫蛋白基因的cdna全序列。該基因全長為675bp,其中5'非編碼區(qū)59bp,3'非編碼區(qū)379bp,開放閱讀框長234bp,編碼78個氨基酸;該蛋白含有14個半胱氨酸,分布在蛋白質(zhì)的n端和c端,呈cc,cx,cxxc形式排列。預(yù)測該蛋白相對分子量為7864.9da;等電點為4.86;37~48位氨基酸間有較強(qiáng)的疏水區(qū)。多序列比對發(fā)現(xiàn)油茶mt核苷酸序列與茶的相似性達(dá)到99%,推導(dǎo)的氨基酸序列與茶完全相同,因此將該基因命名co_mtl。完成機(jī)構(gòu):[1]中南林業(yè)科技大學(xué)經(jīng)濟(jì)林育種與栽培國家重點實驗室,湖南長沙410004 [2]中南林業(yè)科技大學(xué)林學(xué)院,湖南長沙410004 [3]國家油茶科學(xué)中心生物技術(shù)實驗室,湖南長沙410004
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