對于綠色食品的生產(chǎn)過程中可施少量農(nóng)藥，有人可能憂心忡忡，但這是不必要的。農(nóng)藥有許多種類，有高毒品也有低毒品。世界上新發(fā)展起來的不少農(nóng)藥品種都是低毒、低殘留、生物可降解的環(huán)境友好型農(nóng)藥，有的甚至本身就是生物體的正常成分，也就是所謂的生物農(nóng)藥，不會對人體和環(huán)境造成危害。綠色食品既然能夠符合國家標(biāo)準(zhǔn)，就證明它是無污染、無危害、對人安全有益的食品，人們可以放心地食用。
為了確保綠色食品的質(zhì)量，合理使用和管理生產(chǎn)綠色食品的農(nóng)藥，我國特制定了《綠色食品的農(nóng)藥使用規(guī)則》。它是生產(chǎn)綠色食品的生產(chǎn)資料使用系列準(zhǔn)則之一。
規(guī)則規(guī)定，綠色食品生產(chǎn)應(yīng)從作物--病蟲草等整個生態(tài)系統(tǒng)出發(fā)，綜合運用各種防治措施，創(chuàng)造不利于病蟲草害孳生和有利于各類天敵繁衍的環(huán)境條件，保持農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)的平衡和生物多樣化，減少各類病蟲草害所造成的損失。要優(yōu)先采用農(nóng)業(yè)措施，通過選用抗病蟲品種，盡量利用燈光、色彩誘殺害蟲，機械捕捉害蟲，機械和人工除草等措施，防治病蟲草害。
在特殊情況下，必須使用農(nóng)藥時，應(yīng)按綠色食品的分類遵守以下準(zhǔn)則：
aa級綠色食品的農(nóng)藥允許使用aa級綠色食品生產(chǎn)資料農(nóng)藥類產(chǎn)品。在aa級綠色食品生產(chǎn)資料農(nóng)藥類不能滿足植保工作需要的情況下，允許使用某些指定的農(nóng)藥及方法。
a級綠色食品的農(nóng)藥允許使用aa級和a綠色食品生產(chǎn)農(nóng)藥類產(chǎn)品。在aa級和a級綠色食品生產(chǎn)資料農(nóng)藥類產(chǎn)品不能滿足植保工作需要的情況下，允許使用指定的農(nóng)藥及方法。
此外，還需嚴(yán)格執(zhí)行以下規(guī)定：
1.嚴(yán)禁使用劇毒、高毒、高殘留或具有三致毒性(致癌、致畸、致突變)的農(nóng)藥。
2.每種有機合成農(nóng)藥(含a級綠色食品生產(chǎn)資料農(nóng)藥類的有機合成產(chǎn)品)在一種作物的生長期內(nèi)只允許使用一次。
3.有機合成農(nóng)藥在農(nóng)產(chǎn)品中的最終殘留應(yīng)符合gb4285等標(biāo)準(zhǔn)的最高殘留限量(mrl)要求。
4.嚴(yán)禁使用高毒高殘留農(nóng)藥防治貯藏期病蟲害。
5.嚴(yán)禁使用基因工程品種(產(chǎn)品)及制劑。
另外，農(nóng)業(yè)部門根據(jù)各地蔬菜市場農(nóng)藥檢測結(jié)果綜合分析,發(fā)現(xiàn)農(nóng)藥殘留易超標(biāo)的蔬菜有：白菜、青菜、雞毛菜、韭菜、黃瓜、甘藍(lán)、菜豆、芥菜等。其中韭菜、油菜受污染可能性最大。青菜蟲抗藥性較強，菜農(nóng)為了盡快殺蟲,會選擇高毒農(nóng)藥。韭菜的蟲害韭蛆常生長在母體內(nèi),所以菜農(nóng)用大量高毒殺蟲劑灌根，而韭菜具有的內(nèi)吸毒特征使得毒物遍布整個株體。相比較，茄果類蔬菜如青椒、番茄等,嫩英類蔬菜如豆角等,以及鱗莖類蔬菜如蔥、蒜、洋蔥等農(nóng)藥殘留超標(biāo)現(xiàn)象較少。