本研究利用issr和est-ssr標(biāo)記對中國13個(gè)、日本4個(gè)與肯尼亞5個(gè)茶樹品種的遺傳多樣性進(jìn)行分析,重點(diǎn)比較了issr和est-ssr在多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)、引物解析能力、多態(tài)性信息含量和標(biāo)記系數(shù)等方面的差異。結(jié)果表明在位點(diǎn)檢測能力上issr明顯高于est-ssr,每條issr引物可檢測的平均條帶數(shù)（12.5）比每對est-ssr引物（3.1）高三倍。issr標(biāo)記的rp值是est-ssr標(biāo)記的6.3倍,其多態(tài)性信息含量（pic）和標(biāo)記系數(shù)（mi）也明顯高于est-ssr,這表明issr具較高的多態(tài)性位點(diǎn)檢測能力和較高的標(biāo)記效率。est-ssr揭示的nei基因多樣性（h=0.28）高于issr（0.21）,這種差異進(jìn)而會影響到遺傳距離和聚類分析的結(jié)果。在檢測中國、日本和肯尼亞茶樹品種的遺傳差異上,兩種標(biāo)記表現(xiàn)出較一致的趨勢,中國茶樹品種在多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)量、nei基因多樣性、遺傳距離上均大于日本和肯尼亞的茶樹品種。研究還表明,由于est-ssr可檢測到等位位點(diǎn)的變異,它比issr可以更準(zhǔn)確地反映和揭示供試品種的遺傳多樣性水平。同時(shí)由于單個(gè)est-ssr標(biāo)記檢測到的位點(diǎn)數(shù)量較issr標(biāo)記少,且特異性較強(qiáng),譜帶較易分辨,因此比issr標(biāo)記更適用于對大量樣本的分析。完成機(jī)構(gòu)：[1]中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所、國家茶樹改良中心,杭州310008 [2]浙江大學(xué)茶葉研究所,杭州310029