南方紅豆杉播種后一個月左右苗木基本出齊。為防止雜草滋生和土壤板結，除草松土期為4-10月，一般每月進行2-3次，除草機具體措施為株間拔草。南方紅豆杉播種后一個月左右苗木基本出齊。為防止雜草滋生和土壤板結，除草松土期為4-10月，一般每月進行2-3次，除草機具體措施為株間拔草。
為提高苗木成活率和成苗率，促使苗木長勢良好，在苗木生長過程中要適宜施肥和澆水。1年施肥5-6次，第1次于5月上旬施用2%的腐熟的枯餅肥水;第2次于六月上旬施0.5%尿素溶液;第3次于7月下旬施3%的餅肥水;第4次和第5次于9月上旬和下旬施1%的尿素稀釋液;第6次于10月上、中旬為促使苗木早日木質化，施少量鉀肥，提高苗木防凍抗寒的能力。伏天一般每隔1個星期澆水1次，以澆透根基為原則。
林木幼苗均怕水漬，圃地內澇積水，容易導致幼苗根系呼吸受阻而爛根死亡。為此，應經常和及時采取措施使圃地內排水暢通和畦面平整。
每天用噴霧器噴清水1-3次(秋夏季節(jié)每天噴2-3次，冬季每天1次)保持葉面濕潤。11月下旬至次年2月上旬用塑料薄膜搭弓棚覆蓋，以提高床面濕度，扦插2個月后用abt6生根粉20mg/kg溶液噴施2次，促使其提早愈合、生根、5-10月份，每月用0.5%尿素溶液和1%磷酸二氫鉀溶液各噴施1次，促其生長。
南方紅豆杉苗期主要病害有猝倒病、根腐病和葉枯病;害蟲主要為蚯蚓、地老虎、蠐螬、蜘蛛和蚜蟲等。發(fā)生猝倒病可用0.5:0.5:100或1:1:100 倍半量或等量波爾多液噴霧進行防治，每隔7-10天噴一次，連續(xù)噴3-5次。效果良好;發(fā)生根腐病可用多菌靈或甲基托布津500倍溶液進行防治，每隔5- 7天防治1次，連續(xù)3次，可抑制病害擴散蔓延，還要及時拔病株就地燒毀。發(fā)現蚯蚓、地老虎、蠐螬為害，可用呋喃丹挖條撒施于苗床上防治地下害蟲;蜘蛛、蚜蟲可用敵敵畏、樂果類農藥噴殺防治。