原始樣品可為細(xì)胞、組織、培養(yǎng)上清、免疫沉淀或親和純化的蛋白，以下為定性檢測(cè)目的蛋白時(shí)細(xì)胞樣品的處理方法，其余的樣品制備方法參閱相關(guān)文獻(xiàn)。
1．培養(yǎng)細(xì)胞或藥物處理。
2．棄培養(yǎng)基，用1x pbs漂洗細(xì)胞2次，去盡殘留培養(yǎng)基。
3．加入1x sds樣品緩沖液(6-well plate, 100 μl /w或75 cm2plate, 500-1000 μl/瓶)，刮落細(xì)胞，轉(zhuǎn)移到ep管。注意：冰上操作。
4．超聲 10~15秒剪切dna以減低樣品粘性。
5．煮沸樣品5 minutes。
6．離心12000g, 5 min，取上清。
7．電泳分離：上樣15μl~20 μl 至 sds-page 膠 (10 cm x10 cm)電泳。
如要定量檢測(cè)某蛋白的表達(dá)水平，應(yīng)用ripa裂解液(1 ml per 107cells/100 mm dish/150 cm2flask)裂解細(xì)胞，收集裂解液至離心管中，在振蕩器上混勻4～15min，14000g離心15min（4℃），棄沉淀，用bradford法或其它蛋白質(zhì)測(cè)定方法測(cè)定上清中蛋白濃度以調(diào)整上樣體積和上樣量，進(jìn)行western雜交時(shí)還需設(shè)置內(nèi)或外參照，通常用beta-actin。
注意：一般上樣20~30 μg已足夠，如待檢蛋白為低豐度蛋白，可加大上樣量至100μg，但電泳條帶易拖尾，可制備亞細(xì)胞組份或采用更敏感的檢測(cè)方法。