油茶種子est文庫(kù)構(gòu)建及主要表達(dá)基因的分析

發(fā)布時(shí)間:2024-01-29
為研究油茶種子在油脂轉(zhuǎn)化高峰期的基因表達(dá)并分離克隆與油脂合成等有關(guān)的重要基因,以油茶優(yōu)良無(wú)性系湘林1號(hào)和湘林4號(hào)近成熟種子為材料構(gòu)建cdna文庫(kù);隨機(jī)挑取2327個(gè)克隆進(jìn)行3’端測(cè)序構(gòu)建est文庫(kù)。將數(shù)據(jù)完整并無(wú)x、n的1979條edna序列與ncbi核酸數(shù)據(jù)庫(kù)的非冗余序列進(jìn)行同源性比較,確認(rèn)763條cdna序列與核酸數(shù)據(jù)庫(kù)中其他物種的dna序列具有很高或較高的同源性,可確認(rèn)266種基因;有1216個(gè)克隆序列為未知功能的基因序列。各類(lèi)基因表現(xiàn)出不同的表達(dá)豐度,其中貯藏蛋白基因、與基因表達(dá)調(diào)控相關(guān)的基因、抗逆相關(guān)基因、種子成熟和胚胎發(fā)育相關(guān)的基因等為高豐度表達(dá),與脂肪酸代謝相關(guān)的基因等為中豐度表達(dá),另外還有大量的其他基因和未知功能基因在種子中表達(dá)。各類(lèi)基因表達(dá)的數(shù)量和趨勢(shì)與種子接近發(fā)育成熟階段相吻合。完成機(jī)構(gòu):[1]中南林業(yè)科技大學(xué)經(jīng)濟(jì)林育種與栽培國(guó)家林業(yè)局重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,長(zhǎng)沙410004 [2]中南林業(yè)科技大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院,長(zhǎng)沙410004
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