純化水設備一般活性炭過濾器會選擇巴氏消毒；由于活性炭有多孔吸附的特性，大量的toc被吸附后會出現(xiàn)微生物繁殖，長時間運行后產(chǎn)生的微生物一旦泄漏至后端處理單元，勢必會對后端處理單元的使用效果產(chǎn)生影響并帶來很大的微生物污染風險，因此需要為活性炭過濾器設置高溫消毒系統(tǒng)，對其產(chǎn)水的微生物指標進行有效控制；
常見的消毒方式：巴氏消毒、蒸汽消毒、紫外線殺菌方式是活性炭過濾器非常有效的消毒方式。其反洗和正洗可參照多介質過濾器。
紫外線殺菌： 和使用率等的藥劑殺菌不同，采用紫外線殺菌*沒有藥劑殘留，也沒有副產(chǎn)物的生成，消毒效果會一句作用對象的不同而不同。采用uv253.7在1-21mj/cm²（單位：兆焦耳/平方厘米）的照射劑量下可以進行細菌消毒（炭疽（jū）)菌的芽孢例外，劑量為55mj/cm²）（90%不活化））。