中國(guó)一共有兩所海事類大學(xué)上海海運(yùn)學(xué)校，一所是大連海事大學(xué)上海海運(yùn)學(xué)校，進(jìn)入了211工程項(xiàng)目上海海運(yùn)學(xué)校，并且是交通運(yùn)輸部唯一的直屬高校，而另外一所，就是位于上海的上海海事大學(xué)，當(dāng)然后者就沒(méi)有前者命那么好了，發(fā)展也不如前者好。
上海海事大學(xué)的歷史還是很悠久的，可以追溯到1909年創(chuàng)辦的上海高等商船學(xué)堂，1929年改為吳淞商船?？茖W(xué)校，1950年，與上海交通大學(xué)航業(yè)管理系合并升格為上海航務(wù)學(xué)院。1953年，上海航務(wù)學(xué)院、東北航海學(xué)院、福建航海專科學(xué)校三校合并成立大連海運(yùn)學(xué)院(大連海事大學(xué))。
今天的上海海事大學(xué)是在原址上重建的院校，自然實(shí)力沒(méi)有前者那么強(qiáng)大了。1958年，交通部在上海重建上海海運(yùn)學(xué)院，之前去往大連的原上海航務(wù)學(xué)院的部分師資也返回上海，也算是對(duì)上海海運(yùn)學(xué)院的支持了。1962年，海洋運(yùn)輸專業(yè)并入大連海運(yùn)學(xué)院，機(jī)械工程類專業(yè)并入武漢水運(yùn)工程學(xué)院(武漢理工大學(xué)前身之一)，兩校的經(jīng)管類專業(yè)并入，這樣一來(lái)，上海海運(yùn)學(xué)院的交通類專業(yè)遭受到了一定的打擊。
1966年，辦學(xué)方向從海運(yùn)轉(zhuǎn)為水運(yùn)。1981年，獲得碩士學(xué)位授予權(quán)，算是比較早的高校了，1998年獲得博士學(xué)位授予權(quán)。1999年，上海港灣學(xué)校劃歸管理，2000年從交通部下放上海直屬。2004年，正式更名為上海海事大學(xué)。2008年，交通運(yùn)輸部與上海共建上海海事大學(xué)。