1 材料
mastercyclerpcｒ 儀 ( 德 國(guó) eppendorf公司) ; powerpac3000 電 泳 儀 ( 美 國(guó) bio-ｒad 公司) ; iontorrent 高通量測(cè)序平臺(tái)、pico-21 臺(tái)式離心機(jī) ( 美國(guó) thermo fisher 公司) ; gl-88b 漩渦混合器 ( 海門其林貝爾儀器制造有限公司) 。采用 ctab 法分別提取酒曲與酒糟中微生物基因組 dna。具體步驟為樣品預(yù)處理，ctab 法 提 取 緩 沖 液，采 用 tris酚、氯仿、異戊醇抽提，異丙醇沉淀，70%乙醇洗滌，dna 溶解及 ｒna 酶酶解等。再用 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) dna 純度和濃度，－20 ℃保存?zhèn)溆谩＠?用 引 物( 341f、806ｒ) 和 引 物 ( its1f、its2ｒ) 分 別 對(duì)細(xì)菌 16s rdna 的 v3-v4 區(qū)和真菌內(nèi)源轉(zhuǎn)錄間隔its1 區(qū)進(jìn)行 pcｒ 擴(kuò)增，產(chǎn)物使用 2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測(cè)回收，并用 genejet 膠回收試劑盒純化，利用單端測(cè)序的方法，構(gòu)建小片段文庫，構(gòu)建好的文庫經(jīng)過 qubit 定量和文庫檢測(cè)合格后，再采用 ions5tm xl 測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行上機(jī)測(cè)序 ( 北京諾禾致源科技股份有限公司) 。
2 方法與結(jié)果
另有未 得 到 分 類 學(xué) 注 釋 的 菌 群 豐 度 值 為8%，其他真菌菌門豐度值小于 1%。相對(duì)于酒曲，酒糟中細(xì)菌在門分類水平上還包括相對(duì)豐度值較大的放線菌門和藍(lán)細(xì)菌門，并有未得到分類學(xué)注釋的菌群; 而真菌群中兩者在門分類水平上種 類 差 異 較 小，但各菌門的相對(duì)豐度值差異較大。由于高通量測(cè)序技術(shù)分析酒曲與酒糟檢測(cè)出大量微生物，多數(shù)菌群相對(duì)豐度值較低，為方便直觀查看，擬選擇在屬水平上的優(yōu)勢(shì)菌屬 ( 豐度≥1. 0%) 進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，其他 菌 門 ( 豐 度 ＜ 1. 0%) 同 樣 歸 納 為 其 他( others)。也可能是宜賓地區(qū)酒曲*的微生物體系，這與當(dāng)?shù)氐闹魄赜蛐蕴厣芮邢嚓P(guān)。而對(duì)于酒曲和酒糟間存在微生物體系的較大差異性，則可能與廠家發(fā)酵生產(chǎn)白酒的環(huán)境 ( 原料、用水、空氣、窖池等) 及樣品的加工與儲(chǔ)存環(huán)境相關(guān)。
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