近年基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域引入了兩種新方法：
核酸酶靶向切割和釋放技術(shù)（cut&run）
靶向剪切及轉(zhuǎn)座酶技術(shù)（cut&tag）
cut&run和cut&tag檢測(cè)法正在取代chip-seq
簡(jiǎn)化的工作流程跳過(guò)了chip-seq實(shí)驗(yàn)法中的挑戰(zhàn)性步驟，包括染色質(zhì)片段化和抗體pull down，用更少的細(xì)胞和測(cè)序讀數(shù)得到更佳的數(shù)據(jù)。
具體變現(xiàn)為：
1.低細(xì)胞需求量；
2.高吞吐量；
3.操作流程更簡(jiǎn)易；
4.低成本，測(cè)序讀取次數(shù)更少；
5.數(shù)據(jù)質(zhì)量可靠，重復(fù)性好
epicypher cut&tag：
孵育結(jié)合好特異性抗體與靶標(biāo)蛋白后，加入蛋白 a、蛋白g與tn5的復(fù)合物（pag-tn5），使得轉(zhuǎn)座體進(jìn)入細(xì)胞并與抗體結(jié)合，間接地固定在靶蛋白上；激活tn5酶的切割活性，將靶蛋白結(jié)合的dna區(qū)域切斷，從而達(dá)到提取dna、進(jìn)行pcr擴(kuò)增、構(gòu)建文庫(kù)的目的。在tn5上融合了protein a/g抗體結(jié)合功能域的轉(zhuǎn)座體pag-tn5是關(guān)鍵的進(jìn)步，因?yàn)檫@一步允許研究者不必碎裂染色質(zhì)以及進(jìn)行傳統(tǒng)的庫(kù)準(zhǔn)備步驟。
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