qpcr擴(kuò)增過程中，擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的熒光閾值時(shí)的所對(duì)應(yīng)的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)（cycle threshold）。c代表cycle，t代表threshold。簡(jiǎn)單講，ct值就是qpcr中起始模板擴(kuò)增達(dá)到一定產(chǎn)物量時(shí)，所對(duì)應(yīng)的循環(huán)數(shù)。那么你知道qpcr實(shí)驗(yàn)中的ct值有什么作用嗎？讓我們一起來看看吧！
一、指數(shù)擴(kuò)增、模板量與ct值的關(guān)系
理想情況下，qpcr中的基因經(jīng)過一定的循環(huán)數(shù)被指數(shù)擴(kuò)增而積累，擴(kuò)增循環(huán)數(shù)和產(chǎn)物量之間的關(guān)系是：擴(kuò)增產(chǎn)物量=起始模板量×（1+en）循環(huán)個(gè)數(shù)。然而qpcr反應(yīng)并不是一直處于理想情況下，當(dāng)擴(kuò)增產(chǎn)物量達(dá)到“一定產(chǎn)物量”時(shí)，此時(shí)循環(huán)個(gè)數(shù)為ct值，處于指數(shù)擴(kuò)增時(shí)期。ct值與起始模板量的關(guān)系：模板的ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)存在線性關(guān)系。起始模板量濃度越高，ct值越??；起始模板量濃度越低，ct值越大。
二、擴(kuò)增曲線、熒光閾值與一定產(chǎn)物量
qpcr擴(kuò)增產(chǎn)物量是以熒光信號(hào)的形式直接呈現(xiàn)，也就是擴(kuò)增曲線。在pcr早期，擴(kuò)增處于理想情況下，循環(huán)數(shù)較少，產(chǎn)物積累少，產(chǎn)生熒光的水平不能與熒光本底背景明顯地區(qū)別，之后熒光的產(chǎn)生增加進(jìn)入指數(shù)期?？梢栽趐cr反應(yīng)剛處于指數(shù)期的某一點(diǎn)上來檢測(cè)pcr產(chǎn)物的量，以此作為“一定產(chǎn)物量”，并且由此來推斷模板最初的含量。因此，一定產(chǎn)物量對(duì)應(yīng)的熒光信號(hào)強(qiáng)度，也就是熒光閾值。
在pcr的后期，擴(kuò)增曲線不再呈現(xiàn)指數(shù)擴(kuò)增，進(jìn)入線性期和平臺(tái)期。
三、ct值的重現(xiàn)性
pcr循環(huán)在到達(dá)ct值所在的循環(huán)數(shù)時(shí)，剛剛進(jìn)入真正的指數(shù)擴(kuò)增期，此時(shí)微小誤差尚未放大，因此ct值的重現(xiàn)性極hao，即同一模板不同時(shí)間擴(kuò)增或同一時(shí)間不同管內(nèi)擴(kuò)增，得到的ct值是恒定的。
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